Перейти к содержимому

Систематика живых организмов по уиттекеру: Систематика органического мира Открытая биология. Учебник

Содержание

Систематика органического мира Открытая биология. Учебник

Систематика – это часть ботаники и зоологии, изучающая разнообразие форм живого. Систематика даёт научные названия организмам, оценивает черты сходства и различия между ними. Важной частью систематики является таксономия, целью которой является разделение организмов на группы (таксоны) и расположение этих групп в порядке, отражающем их родственные связи и иерархию. Существует несколько методов определения относительного положения таксона в системе.

Основными таксонами являются царство, тип (отдел), класс, отряд (порядок), семейство, род, вид. Каждая предыдущая группа в этом списке объединяет несколько последующих (так, семейство объединяет несколько родов и, в свою очередь, принадлежит к какому-либо отряду или порядку). По мере перехода от высшей иерархической группы к низшей степень родства возрастает. Для более детальной классификации используются вспомогательные единицы, названия которых образуются прибавлением к основным единицам приставок  над-  и  под- , например, надцарство, подвид.

Только виду можно дать относительно строгое определение, все остальные таксономические группы определяются достаточно произвольно.

Попытки классификации живой материи предпринимались учёными неоднократно. Среди первых попыток можно вспомнить труды Аристотеля по зоологии и Теофраста по ботанике. Начало современной систематике положила «Система природы» Карла Линнея. Он разделил всех животных на шесть классов: звери, птицы, гады, рыбы, насекомые и черви, а все растения – на несколько классов по способу размножения. К середине XIX века некоторые учёные (например, Эрнст Геккель) наравне с животными и растениями стали выделять новое царство протистов, в которое вошли бактерии, водоросли, грибы и одноклеточные животные.

С развитием микробиологии стало ясно, что одной из важнейших характеристик организмов является их клеточное строение. В результате, в первой половине XX века были выделены два надцарства – прокариоты и эукариоты. Надцарство прокариот включило в себя бактерии и сине-зелёные водоросли, клетки которых не содержат ядра.

Остальные клеточные организмы были отнесены к ядерным (эукариотам).

Особой формой, промежуточной между живым и неживым состоянием, являются вирусы, отличающиеся от всех остальных организмов отсутствием важнейшего признака организации живой материи   клеточного строения. Некоторые исследователи, чтобы показать отличие вирусов от других организмов, вводят новый таксон – империю – и включают в одну из империй вирусы, а в другую – все клеточные организмы.

В 90-х годах XX века учёные обратили пристальное внимание на очень древнюю и сравнительно малочисленную группу архебактерий. Выяснилось, что хотя клетка архебактерии и не содержит ядра, она разительно отличается по строению и от клетки эукариот, и от клетки прокариот. В результате архебактерии, рассматривавшиеся ранее как один из классов бактерий, в настоящее время нередко выделяются в отдельное царство или даже надцарство.

Итак, в основу деления организмов по надцарствам положено строение клетки. Что касается деления эукариот на царства, то устоявшейся точки зрения пока ещё нет. Любые искусственные разграничения нарушают естественные связи между организмами. Действительно, существует большое количество отличительных признаков, по каждому из которых может быть произведена классификация; среди них:

  • строение организма;
  • способ получения органических веществ;
  • способность к передвижению.

В советских учебниках долгое время была распространена классификация эукариот по способу питания, подразумевавшая разделение надцарства эукариот на три царства: растения (фотосинтезирующие автотрофы), грибы (в основном, осмотрофные гетеротрофы) и животные (в основном, голозойные гетеротрофы). Однако, в эту схему достаточно сложно уложить, например, эвгленовые водоросли, которые могут питаться как автотрофно, так и гетеротрофно.

В 1969 году Робертом Уиттекером была предложена система пяти царств, завоёвывающая сейчас всё больше и больше сторонников. Прокариоты у него по-прежнему объединены в одно царство Monera. Примитивные эукариоты, не имеющие тканевой дифференциации (простейшие, водоросли, слизевики), объединены в царство Protista. Всё, что осталось от растений, (мхи, папоротники и семенные растения) составило царство Plantae, все высшие классы грибов – царство Fungi, все многоклеточные животные – царство Animalia.

Эта система, однако, тоже имеет свои недостатки. Среди них:

  • систематическое положение оомицетов и слизевиков, являющихся промежуточными формами между протистами и грибами, пока что не ясно;
  • сами грибы обладают многими признаками, сближающими их с протистами (таковыми, в частности, является отсутствие истинных тканей).

В изложении данного курса мы будем основываться на системе Уиттекера, выделяя по результатам новейших исследований дополнительное шестое царство архебактерий.

Система пяти царств Уиттекера (авторский рисунок)

В заключение ещё раз отметим отличительные признаки основных царств природы.

ЦарствоБактерииАрхебактерииПростейшиеРастенияГрибыЖивотные
EubacteriaArchaebacteriaProtistaPlantaeFungiAnimalia
КлеткаЯдро и органеллы отсутствуют, обычно муреиновая клеточная стенкаЯдро и органеллы отсутствуют, в клеточной стенке нет муреина, строение генетического материала близко к эукариотамЕсть ядро, некоторые группы – организмы с многоядерными клетками Есть ядро, клеточная стенка из целлюлозы, имеются вакуоли и хлоропластыЕсть ядро, жёсткая клеточная стенка из хитина или целлюлозыЕсть ядро, жёсткая клеточная стенка отсутствует
Строение телаВ основном, одноклеточные организмы. Встречаются также многоклеточные (колониальные) формыОдноклеточные и многоклеточные организмы, разделение на ткани отсутствуетМногоклеточные организмы с разделением на тканиКак правило, многоклеточные организмы, состоящие из мицелия, поперечные стенки между клетками в мицелии отсутствуютМногоклеточные организмы с разделением на ткани и органы
Способ питанияГетеротрофы и автотрофыХемосинтезирующие автотрофы и гетеротрофы, фотосинтезирующие гетеротрофыГетеротрофы и фотосинтезирующие автотрофыФотосинтезирующие автотрофыОсмотрофные гетеротрофыГолозойные гетеротрофы
Способность к передвижениюСвободнодвижущиеся организмыСвободнодвижущиеся и прикреплённые формыВозможность активного передвижения отсутствуетУ большинства форм свободное передвижение
Систематика органического мира

 

Первые семь глав курса можно условно назвать биологией организмов. Здесь рассказывается о различных группах живых существ, населяющих Землю: вирусах и бактериях, протистах, грибах и лишайниках, растениях, беспозвоночных и позвоночных животных. Заканчивается эта часть рассмотрением особенностей строения человека. Вторая часть курса, состоящая из пяти глав, – общая биология. В ней даётся анализ различных уровней и форм организации живого: органические молекулы, клетки, ткани, органы и системы органов, отдельные организмы, популяции и сообщества. Заканчивается эта часть изучением биосферы.

Многообразие живых организмов. Систематика - УчительPRO

«Многообразие живых организмов.
Систематика. Классификация организмов»

Ключевые слова конспекта: многообразие живых организмов, систематика, биологическая номенклатура, классификация организмов, биологическая классификация, таксономия.



В настоящее время на Земле описано более 2,5 млн видов живых организмов. Для упорядочении многообразия живых организмов служат систематика, классификация и таксономия.

Систематика — раздел биологии, задачей которого является описание и разделение по группам (таксонам) всех существующих ныне и вымерших организмов, установление родственных связей между ними, выяснение их общих и частных свойств и признаков.

 

Разделами биологической систематики являются биологическая номенклатура и биологическая классификация.

 

Биологическая номенклатура

Биологическая номенклатура заключается в том, что каждый вид получает название, состоящее из родового и видового имён. Правила присвоения видам соответствующих имён регулируются

международными номенклатурными кодексами.

Для международных названий видов используется латинский язык. В полное название вида входит также фамилия учёного, описавшего данный вид, а также год публикации описания. Например, международное название домового воробьяPasser domesticus (Linnaeus, 1758), а полевого воробьяPasser montanus (Linnaeus, 1758).  Обычно в печатном тексте названия видов выделяют курсивом, а имя описавшего и год описания — нет.

Требования кодексов распространяются только на международные названия видов. По-русски можно писать и «воробей полевой» и «полевой воробей».

 



Биологическая классификация

Классификация организмов использует иерархические таксоны (систематические группы). Таксоны имеют различные ранги (уровни). Ранги таксонов можно разделить на две группы: обязательные (любой классифицированный организм относится к таксонам этих рангов) и дополнительные (используемые для уточнения взаимного положения основных таксонов). При систематизировании различных групп используется разный набор дополнительных рангов таксонов.

Таксономия — раздел систематики, разрабатывающий теоретические основы классификации. Таксон искусственно выделенная человеком группа opганизмов, связанных той или иной степенью родства и. в то же время, достаточно обособленная, чтобы ей можно было присвоить определенную таксономическую категорию того или иного ранга.

В современной классификации существует следующая

иерархия таксонов: царство, отдел (тип в систематике животных), класс, порядок (отряд в систематике животных), семейство, род, вид. Кроме того, выделяют промежуточные таксоны: над- и подцарства, над- и подотделы, над- и подклассы и т.д.

Таблица «Многообразие живых организмов»


Это конспект по теме «Многообразие живых организмов». Выберите дальнейшие действия:

Революция в систематике

Сергей Владимирович Багоцкий,
кандидат биологических наук
«Химия и жизнь» №6, 2010

Систематику считают наиболее традиционным и консервативным разделом биологии. Классы, отряды, семейства, роды, виды... В эпоху молекулярной биологии кому все это интересно?

На самом деле интересно. Во все эпохи находилось некоторое число исследователей, которые занимались этим странным делом. Серьезные люди смотрели на них как на блаженных. «Он химик, он ботаник, князь Федор, мой племянник», — с иронией говорила светская дама из «Горя от ума».

В конце XIX века химики стали выглядеть более респектабельно, в то время как на «ботаников» продолжали смотреть с удивлением. При этом в общую категорию «ботаников» широкая общественность включала всех систематиков — не только растений, но и червей, насекомых, рыб, птиц и т. д.

К началу ХХ века систематика казалась полностью завершенной (как, впрочем, и классическая физика). Оставалось лишь нанести несколько заключительных мазков... Оказалось, однако, что все не так. Систематику пришлось не достраивать, а перестраивать. И на уровне самых крупных групп — царств и отделов, и на уровне групп более мелких.

Для этого, вообще говоря, были две причины. Во-первых, появилась возможность изучать достаточно тонкие детали строения клеток. Это изучение показало, что клетки разных живых организмов вовсе не так одинаковы, как казалось раньше. Особенности строения клеток стали рассматриваться как важный признак, характеризующий большие группы живых организмов.

Имелась и вторая причина. Молекулярные биологи научились определять последовательность аминокислот в белках и последовательность нуклеотидов в нуклеиновых кислотах, и это умение стали использовать в систематике.

Поговорим об этом более подробно. Предположим, что мы сравнили последовательности нуклеотидов в каком-то гене у разных животных. Эти последовательности будут похожими, но не совсем одинаковыми, поскольку достаточно длительное время виды не были генетически связанными и эволюционировали независимо друг от друга. При определенных допущениях (о которых мы здесь говорить не будем) получается, что число различий в нуклеотидных последовательностях у двух видов будет прямо пропорциональным времени, прошедшему с момента расхождения эволюционных ветвей, ведущих к этим видам.

Таким образом, сравнивая аминокислотные и нуклеотидные последовательности двух видов, мы можем сказать, насколько давно жил их последний общий предок. Если же мы проведем такое сравнение для нескольких видов, то можно будет построить эволюционное дерево для целой группы. А ветвям этого дерева присвоить ранг отрядов или семейств.

Традиционная систематика — не столько наука, сколько искусство. Специалист, занимающийся той или иной группой, должен был анализировать множество признаков и решать, какие признаки свидетельствуют о родстве, а какие — нет. Анализ нуклеотидных последовательностей породил надежды на то, что систематика в недалеком будущем превратится в строгую науку. А для успешных занятий систематикой вовсе не нужно будет видеть изучаемые объекты живьем — достаточно изучить последовательности нуклеотидов в том или ином гене.

Если этот прогноз оправдается, то будет очень жалко. Исчезнет одна из субкультур, и жизнь человеческого общества станет менее красочной.

В старые добрые времена весь мир живых организмов делили на царство растений и царство животных. При этом к растениям относили и водоросли, и грибы, и бактерии. Царства растений делили на отделы, царства животных — на типы, и так далее.

Эту красивую схему портило постепенное осознание того факта, что клетки бактерий и клетки остальных «растений» устроены принципиально по-разному. В клетках бактерий нет отделенного от цитоплазмы ядра, совершенно по-другому устроена клеточная оболочка, нет внутриклеточных нитей, позволяющих тянуть крупные частицы, перемещая их из одного места в другое. Осознание глубины этих различий привело к появлению терминов «прокариоты» и «эукариоты». Прокариоты — это бактерии и так называемые сине-зеленые водоросли (более точно другое название — цианобактерии), в клетках которых нет отделенного от цитоплазмы ядра. Эукариоты — это все остальные.

Понятия «прокариоты» и «эукариоты» ввел в 1925 году Эдвард Шаттон, предлагавший выделить прокариот в самостоятельное царство, но потребовалось еще более четверти века для того, чтобы осознать, что различия между прокариотами и эукариотами очень глубоки, гораздо глубже, чем различия между растениями и животными. Это осознание позволило Херберту Коупланду (1947,1956) и Роберту Уиттакеру (1959) предложить новые системы животного мира.

Оба автора вслед за Шаттоном выделили прокариот в самостоятельное царство. Кроме того, они исключили водоросли из царства растений и так называемых простейших животных — из царства животных, объединив их в царство протистов. Уиттакер исключил грибы из царства растений, превратив их в самостоятельное царство.

По системе Уиттакера, существовало уже не два, а пять царств: прокариоты (монеры), протисты, растения, грибы, животные, причем прокариоты неявно противопоставлялись всем остальным.

В конце 1970-х годов научный мир обратил внимание на так называемых архебактерий. Оказалось, что существует небольшая группа прокариот, клетки которых по своему химическому составу ближе к эукариотам, чем к прокариотам. После непродолжительных дискуссий стало очевидно, что прокариот следует разделить на два царства: настоящих бактерий (эубактерий) и архебактерий. Это разделение было обосновано в работах Карла Везе.

Царств стало шесть, с вирусами семь. Революционные изменения в систематике набирали скорость. Их следующей «жертвой» сделалось царство протистов — просто устроенных эукариот.

В учебниках зоологии традиционно рассматривается тип простейших животных, который относят к царству животных. Так было до работ Коупланда и Уиттакера, так продолжается и по сей день (с той только разницей, что теперь этот тип произвели в подцарство), поскольку преподавать по старинке привычнее и удобнее. А в учебниках по ботанике рассматривается около десятка отделов водорослей, связи между которыми остаются непонятными. Иногда их относят к царству растений, а иногда и не относят. Некоторые группы организмов (эвгленовые, динофлагелляты) рассматриваются и в курсе зоологии, и в курсе ботаники, причем зоологи считают их отрядами класса жгутиконосцев, а ботаники — отделами царства растений. Полный беспорядок!

Системы Коупланда и Уиттакера попытались его устранить, назвав простейших животных и одноклеточные водоросли не растениями и животными, а протистами. Но явная сборность этой группы бросалась в глаза и побуждала систематиков создавать системы, в которых протисты были разделены на много царств.

В 1984 году Гордн Лидейл разделил мир живых организмов на 17 царств, большинство из которых возникли в результате распада царства протистов. После этого начался бум многоцарственных систем, продолжающийся и поныне.

Так сколько же царств живых организмов признает современная биология? Ответить на этот вопрос затруднительно. Каждый год выходят работы с новыми вариантами разделения на царства. Невольно вспоминается популярный в среде физиков стишок: Был этот мир глубокой тьмой окутан. Да будет свет! И вот явился Ньютон. Но Сатана недолго ждал реванша, Пришел Эйнштейн, и стало все, как раньше. Изменения происходят не только на уровне царств, но и на уровне значительно меньших систематических групп. Давайте посмотрим, что за последний десяток лет произошло с такой, казалось бы, хорошо изученной группой, как плацентарные млекопитающие. Для тех, кто забыл школьную биологию, напоминаю, что современные млекопитающие делятся на яйцекладущих (утконос, ехидна), сумчатых (опоссумы, кенгуру и другие животные, выращивающие детей в сумке) и плацентарных (всех остальных, которые рождают живых детенышей).

Исследования генов и геномов животных, проводившиеся в последние годы в разных лабораториях, неожиданно показали, что плацентарные млекопитающие делятся на четыре группы.

Первая группа получила название Laurasiotheria (азиатские звери). К ней относятся обитающие в России представители отряда насекомоядных (кроты, ежи, бурозубки и т. д.), а также представители отрядов рукокрылых (летучих мышей), хищных, непарнокопытных (лошади, носороги), парнокопытных (свиньи, олени, антилопы, быки, козы, овцы), китообразных, ластоногих, а также некоторых других мелких отрядов. По своему происхождению эта группа связана с Европой, Азией и Северной Америкой.

Вторая группа — Afrotheria (африканские звери). К ней относятся обитающие в Африке и на Мадагаскаре представители отряда насекомоядных (прыгунчики, тенреки, златокроты и т. д.), хоботные, даманы, сирены (ламантин, вымершая стеллерова корова и др.). По своему происхождению эта группа связана с Африкой.

Третью группу назвали Euarchontoglires. К ней относятся приматы, грызуны, зайцеобразные и некоторые другие.

Четвертая группа, неполнозубые, включает единственный отряд неполнозубых (ленивцы, броненосцы, муравьеды), все представители которых живут в Южной Америке.

В чем принципиальная революционность полученных результатов?

Во-первых, приказал долго жить отряд насекомоядных, объединяющий наиболее примитивных плацентарных млекопитающих. О том, что отряд насекомоядных представляет собой сборную группу и должен быть расформирован, зоологи говорили давно и не раз. Теперь под эту точку зрения подведена серьезная молекулярная база. Насекомоядных несомненно следует разделить на два отряда, которые можно условно назвать «насекомоядные-1» в группе азиатских зверей и «насекомоядные-2» в группе африканских зверей.

Непонятен статус живущего на Кубе редкого млекопитающего щелезуба. По традиционной системе он относился к насекомоядным, однако же по своим генам он не похож ни на насекомоядных-1, ни на насекомоядных-2. Достоверно отнести его в одну из четырех групп плацентарных млекопитающих не удается. Возможно, что щелезуб — это пятая группа и для него придется ввести новый отряд «насекомоядные-3».

Во-вторых, выявлено совершенно неожиданное родство приматов и грызунов. Оказывается, человек довольно-таки близок к крысе. Кто бы мог подумать?!

В-третьих, вскрылись неожиданные исторические связи внутри групп. Так, теперь известно, что по своим генам китообразные очень близки к гиппопотаму (отряд парнокопытных) и достаточно далеки от хищных, с которыми их раньше связывали. Впрочем, это не так уж необычно: например, один и тот же отряд ископаемых млекопитающих кондиляртр породил и хищных млекопитающих «первого поколения» (например, гигантского эндрюсарха), и разнообразных копытных животных. А современный отряд хищных млекопитающих имеет иное происхождение.

Традиционная зоология сближает китообразных с хищными млекопитающими. Современная зоология вносит в это сближение поправку: китообразные близки к вымершим хищникам «первого поколения», которые эволюционно близки к парнокопытным.

Вдохновенные генетической близостью китообразных и парнокопытных, некоторые зоологи предложили даже создать новый отряд китопарнокопытных.

Несколько слов насчет наших ближайших родственников. И здесь не обошлось без сенсации. Как мы знаем, сравнение генов животных, принадлежащих к разным группам, позволяет оценить, как давно разветвились веточки, ведущие к этим группам. Так вот, оказалось, что веточки, ведущие с одной стороны к человеку, а с другой стороны — к шимпанзе и горилле, разветвились всего-навсего пять (может быть, немного больше) миллионов лет назад. Сначала отделилась веточка к горилле, чуть позже — к шимпанзе. При этом в настоящее время известны находки подозрительных на прямохождение приматов, живших 6–7 миллионов лет назад (оррорин, сахелантроп). Результат допускает два объяснения. Либо шимпанзе и горилла были потомками уже прямоходящих приматов, либо оррорин и сахелантроп принадлежали к другой ветви высших обезьян, в которой тоже шла эволюция в общем направлении к человеку.

Что же касается орангутана, то исследование его ДНК никаких сюрпризов не принесло. Ветвь, ведущая к нему, отделилась от человеческой ветви где-то 12 миллионов лет назад, как и предполагалось ранее. Все это заставляет отказаться от семейства понгид (горилла, орангутан, шимпанзе), разделив его на два. В одном семействе останется орангутан, в другом — горилла и шимпанзе.

У систематики, считавшейся еще недавно старой и неинтересной отраслью знаний, началась вторая молодость. Лишнее свидетельство того, что наши представления о «современном» и «несовременном» относительны.

Презентация к уроку по биологии на тему: Систематика живого мира

Слайд 1

Систематика живого мира

Слайд 2

Систематика – раздел биологии, задачей которого является изучение биологического разнообразия; выявление, описание всех существующих и вымерших групп живых организмов и их классифицирование согласно родственным взаимоотношениям. Теорией и практикой описания и наименования живых организмов занимается таксономия . Номенклатура – это система названий живых организмов и положений по образованию и употреблению этих названий.

Слайд 3

Основные таксономические (систематические) категории № Наименование категории (русское) Наименование категории (латинское) Примечание 1 Империя imperium 2 Царство regnum 3 Отдел (тип у животных) divisio (phylum, typus) В некоторых системах классификации животных категории «отдел» и «тип» не являются равнозначными 4 Класс classis 5 Легион legio Необязательная категория 6 Когорта cohors Необязательная категория 7 Порядок (отряд у животных) ordo 8 Семейство familia 9 Триба tribus Необязательная категория 10 Род genus 11 Вид species

Слайд 4

Общепринятые стандартные окончания в латинских названиях таксонов Таксоно- мическая категория Царства живого мира Бактерии, Архебактерии Протисты Растения Грибы Животные Вирусы Царство – – – – – – Отдел (тип) – – - phyta - mycota – – Подотдел (подтип) – – - phytina - mycotina – – Класс – – – -mycetes – – Подкласс – – – -mycetidae – – Порядок (отряд) -ales – -ales -ales – – Подпорядок (подотряд) – – -ineae -ineae – – Надсемейство – – -acea -acea -oidea – Семейство -aceae – -aceae -aceae -i d ae -viridae Подсемейство -oideae – -oideae -oideae -inae -virinae Триба – – -eae -eae -ini – Подтриба – – -inae -inae -ina – Род – – – – – -virus Вид – – – – – –

Слайд 5

Система живого мира № Царства живого мира Количество видов Империя клеточные Надцарство доядерные 1 БАКТЕРИИ 5 000 2 АРХЕБАКТЕРИИ 110 Надцарство ядерные 3 ПРОТИСТЫ 66 000-74 000 4 РАСТЕНИЯ 290 000 5 ГРИБЫ 53 000-62 000 6 ЖИВОТНЫЕ 1-2 млн Империя доклеточные 7 ВИРУСЫ 1 600

Слайд 6

Протисты Акантарии Криптофитовые водоросли Протисты с неясным систематическим положением Апикомплексы Лабиринтулиды Ресничные Воротничковые жгутиконосцы Мезомицеты Сапролегнии (оомицеты) Гаплоспоридии Микроспоридии Слизевики (оомицеты) Гаптофиты Миксоспоридии Солнечники Глаукофитовые водоросли Многожгутиковые Феодарии Динофитовые водоросли Опалины Фораминиферы Зелёные водоросли Охрофиты Церкозои Корненожки Плазмодиофоровые Эвгленовые Красные водоросли Полицистины

Слайд 7

Растения № Наименование отдела Приблизительное кол-во видов Подцарство низшие (слоевищные) растения ( Tallophyta ), настоящие водоросли ( Phycobionta ) 1 Криптофитовые водоросли ( Cryptophyta ) 100–200 2 Динофитовые водоросли ( Dinophyta ) 500 3 Золотистые водоросли ( Chrysophyta ) 300 4 Диатомовые водоросли ( Bacillariophyta ) 12 000 5 Бурые водоросли ( Phaeophyta ) 1 500 6 Желтозеленые водоросли ( Xanthophyta ) более 350 7 Эвгленовые водоросли ( Euglenophyta ) 900 8 Зеленые водоросли ( Chlorophyta ) 13 000–20 000 9 Харовые водоросли ( Charophyta ) 300 Подцарство багрянковые (красные водоросли) ( Rhodophyta , Rhodobionta ) 10 Красные водоросли ( Rhodophyta ) 3 800–4 000 Подцарство высшие (зародышевые) растения ( Embryophyta , Embryobionta ) 11 Псилотовидные ( Psilotophyta ) 12 12 Моховидные ( Bryophyta ) 20 000–25 000 13 Плауновидные ( Lycopodiophyta ) 970–1 270 14 Хвощевидные ( Equisetophyta ) 20–35 15 Папоротниковидные ( Polypodiophyta ) 12 000 16 Голосеменные ( Pinophyta , Gymnospermae ) 600 17 Покрытосеменные (Цветковые) ( Magnoliophyta , Angiospermae ) 250 000

Слайд 8

Современная классификация растений № Наименование отдела Приблизительное кол-во видов 1 Моховидные ( Bryophyta ) 20 000–25 000 2 Плауновидные ( Lycopodiophyta ) 970–1 270 3 Псилотовидные ( Psilotophyta ) 12 4 Хвощевидные ( Equisetophyta ) 20–35 5 Папоротниковидные ( Polypodiophyta ) 12 000 6 Саговниковидные (Цикадовые) ( Cycadophyta ) 130 7 Гингковидные ( Ginkgophyta ) 1 8 Голосеменные (Хвойные) ( Gymnospermae , Pinophyta , Coniferophyta ) 560 9 Гнетовидные (Gnetophyta) 600 10 Покрытосеменные (Цветковые) ( Magnoliophyta , Angiospermae ) 250 000

Слайд 9

Грибы № Наименование отдела Приблизительное количество видов Подцарство настоящие грибы ( Eumycota ) 1 Хитридиомицеты ( Chytridiomycota ) 500 2 Зигомицеты ( Zygomycota ) 500 3 Аскомицеты ( Ascomycota ) 30 000 4 Базидиомицеты ( Basidiomycota ) 30 000 5 Несовершенные грибы ( Deuteromycota , Fungi imperfecti ) 30 000 Подцарство оомицеты ( Oomycota ) 6 Оомицеты ( Oomycota ) 550 Подцарство слизевики ( Myxomycota ) 7 Слизевики ( Myxomycota ) 500

Слайд 10

Современная к лассификация грибов № Наименование отдела Приблизительное количество видов 1 Хитридиомицеты (хитридиевые грибы) ( Chytridiomycota ) 500–700 2 Гифохитридиомицеты (гифохитридиевые грибы) (Hyphochytridiomycota) 23 3 Зигомицеты ( Zygomycota ) 500 4 Аскомицеты ( Ascomycota ) 30 000 5 Базидиомицеты ( Basidiomycota ) 22 000–30 000

Слайд 11

Животные: современная классификация № Наименование типа 1 Губки (Porifera) 2 Пластинчатые (Placozoa) 3 Гребневики (Ctenophora) 4 Стрекающие (Cnidaria) 5 Кольчатые черви (Annelida) 6 Погонофоры (Pogonophora) 7 Эхиуриды (Echiura) 8 Звездчатые черви (Sipuncula) 9 Моллюски (Mollusca) 10 Немертины (Nemertini) № Наименование типа 11 Лобатоцеребриды (Lobatocerebrida) 12 Ксенотурбеллиды ( Xenoturbellida ) 13 Плоские черви (Plathelminthes) 14 Ортонектиды (Orthonectida) 15 Дициемиды (Dicyemida) 16 Гнатостомулиды (Gnathostomulida) 17 Микрочелюстные (Micrognathozoa) 18 Коловратки (Rotifera) 19 Скребни (Acanthocephala) 20 Циклиофоры (Cycliophora) 21 Камптозои (Kamptozoa) 22 Брюхоресничные (Gastrotricha)

Слайд 12

№ Наименование типа 23 Членистоногие (Arthropoda) 24 Онихофоры (Onychophora) 25 Тихоходки (Tardigrada) 26 Круглые черви (Nemata) 27 Волосатиковые (Nematomorpha) 28 Головохоботные черви (Cephalorhyncha) 29 Форониды (Phoronida) 30 Мшанки (Bryozoa) 31 Брахиоподы (Brachiopoda) 32 Щетинкочелюстные (Chaetognatha) 33 Полухордовые (Hemichordata) 34 Иглокожие (Echinodermata) 35 Хордовые (Chordata)

Слайд 13

Вендобионты

Слайд 14

Вендобионты

Систематика организмов

Человек, познавая окружающий мир, всегда стремится уловить сходство и различия между явлениями, выявить между ними связь и установить соподчиненность, то есть привести их в систему. Такая систематизация не только облегчает процесс познания, но и поднимает его на новую ступень.

В биологии, где ученым приходится иметь дело с великим многообразием живых организмов, систематика приобрела особое значение, превратившись из вспомогательного инструмента познания в отдельную биологическую дисциплину.

Принцип классификации

Классификация (систематика) в биологии — это система, распределяющая живые организмы по степени родства. Понятие «вид» в систематике первым ввел К. Линней. Он назвал видом совокупность особей, «сходных, как дети одних родителей» и способных давать плодовитое потомство. Сходные виды объединяются в род.

Карл Линней (1707—1778) — шведский естествоиспытатель и натуралист, создавший первую удачную систематику растений и животных, объединив их в группы по внешним признакам. Линней первым ввел бинарную номенклатуру, установил четкую иерархию между систематическими категориями, которых он выделили 4: вид, род, отряд, класс. Ученый разделил растительный мир на 24 класса, животный — на 6 классов (млекопитающие, птицы, гады, объединявшие земноводных и пресмыкающихся, рыбы, черви, насекомые). Человека он отнес к животному миру, включив в класс млекопитающих.

Линней дал каждому виду организмов латинское название, состоящее из двух слов, первое из которых означает название рода, а второе — вида, то есть ввел бинарную номенклатуру. Например, заяц-русак получил название Lepus timidus, где Lepus — название рода (заяц), timidus — название вида (трусливый). В род Lepus входят и другие виды зайцев. В наши дни латынь, как язык науки, сдала свои позиции, но по-прежнему каждый новый вид живых организмов получает научное название на латыни. Это помогает избежать путаницы, ведь одно и то же растение или животное на разных языках часто называется по-разному.

Основные группы

Вид — это основная единица в системе классификации живых организмов. Особи разных видов, как правило, в природе не скрещиваются, однако изредка встречаются межвидовые гибриды растений или животных. Близкородственные виды группируются в более крупную систематическую единицу — род. У Линнея сходные роды объединялись в отряды (у животных) или порядки (у растений), а те — в классы. После Линнея систематика продолжала развиваться. Ж. Кювье разделил всех животных на 4 большие группы, назвав их ветвями, но А. Бенвиль предложил для них более удачный термин — «тип». Тип — это высшая систематическая категория, объединяющая классы.

Существует несколько видов казарок, среди них: 1 — краснозобая; 2 — американская; 3 — белощекая. Все они относятся к роду казарок, семейству утиных, отряду гусеобразных, классу птиц

Позднее между родом и отрядом (порядком) была введена категория «семейство». В результате получилось 6 основных категорий: тип, класс, отряд, семейство, род, вид. Некоторые роды состоят из сотен и даже тысяч видов (например, у насекомых), а некоторые — лишь из одного (род выхухоль). Поэтому и разные типы включают различное количество живых организмов.

Современная наука

Линней считал, что все виды организмов созданы Богом и остаются неизменными. Он объединял их в более крупные категории по сходству некоторых признаков, но не учитывал, что порой внешнее сходство обманчиво, и нередко относил к одной группе совершенно неродственные организмы. То есть классификация Линнея была искусственной, и многие ее положения позже были пересмотрены.

Лошадь (1) и осел (2) относятся к одному семейству — лошадиных. При их скрещивании был получен гибрид — мул (3), однако его нельзя считать особым видом, так как он не дает потомства

Над созданием естественной классификации, которая, подобно генеалогическому древу, должна отражать происхождение организмов, ученые работают до сих пор. Новейшие исследования приводят к появлению новых видов и родов. Часто оказывается, что некоторые формы занимают промежуточное положение между какими-нибудь группами. Поэтому пришлось ввести промежуточные категории, и появились подвиды и надвиды, подклассы и надклассы и т. д. При этом и число видов, и состав основных групп сильно варьируются в зависимости от взглядов ученых-систематиков.

Поделиться ссылкой

Систематика живых организмов

В настоящее время на Земле описано более 2,5 млн. ви­дов живых организмов. Однако реальное число видов на Земле в несколько раз больше, так как многие виды мик­роорганизмов, насекомых и др. не учтены. Кроме того, счи­тается, что современный видовой состав – это лишь около 5% от видового разнообразия жизни за период ее суще­ствования на Земле. Для упорядочения такого многообразия живых организмов служат систематика, классификация и таксономия.

Система­тика раздел биологии, занимающийся описанием, обозна­чением и классификацией существующих и вымерших орга­низмов по таксонам.

Классификация распределение всего множества живых организмов по определенной системе иерар­хически соподчиненных групп – таксонов.

Таксономия раз­дел систематики, разрабатывающий теоретические основы клас­сификации.

Таксон искусственно выделенная человеком груп­па организмов, связанных той или иной степенью родства, до­статочно обособленная, чтобы ей можно было присвоить опре­деленную таксономическую категорию того или иного ранга. Наименьшая таксономическая единица – вид. В современной систематике живых организмов существу­ет следующая иерархия таксонов: царство, отдел (тип в систе­матике животных), класс, порядок (отряд в систематике жи­вотных), семейство, род, вид. Кроме того, выделяют промежу­точные таксоны: над- и подцарства, над- и подотделы и т.д. Систематика живых организмов постоянно изменяется и обновляется. Основные крупные таксоны живых организмов приведены ниже.

Неклеточные формы

царство ВИРУСЫ

Клеточные формы – надцарство Прокариоты (безъядерные) и надцарство Эукариоты (с оформленным ядром)

Надцарство Прокариоты

Царство АРХЕБАКТЕРИИ (ДРЕВНИЕ БАКТЕРИИ)

Царство ЭУБАКТЕРИИ (НАСТОЯЩИЕ БАКТЕРИИ)

Царство ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ ВОДОРОСЛИ: отдел Цианобактерии, отдел Прохлорофиты

Надцарство Эукариоты

Царство ГРИБЫ

– подцарство Слизевики: отдел Миксомицеты

– подцарство Грибы: отдел Хитридиомицеты, отдел Оомицеты, отдел Зигомицеты, отдел Аскомицеты или Сумчатые грибы, отдел Базидиомицеты, отдел Дейтеромицеты или Несовершенные грибы

– Лишайники

Царство РАСТЕНИЯ

– подцарство Багрянки: отдел Красные водоросли

– подцарство Настоящие водоросли: отдел Зеленые водоросли, отдел Золотистые водоросли, отдел Желто-зеленые водоросли, отдел Диатомовые водоросли, отдел Бурые водоросли, отдел Пирофитовые водоросли, отдел Эвгленовые водоросли

– подцарство Высшие растения: отдел Моховидные, отдел Риниовидные, отдел Плауновидные, отдел Хвощевидные, отдел Папоротниковидные, отдел Голосемянные, отдел Покрытосемянные (класс Однодольные, класс Двудольные)

Царство ЖИВОТНЫЕ

– подцарство Одноклеточные: тип Саркомастигофоры (класс Жгутиконосцы, класс Саркодовые), тип Споровики, тип Инфузории

– подцарство Многоклеточные: тип Губки, тип Кишечнополостные (классы Гидроидные полипы, Сцифоидные полипы, Коралловые полипы), тип Гребневики, тип Плоские черви (классы Моногенетические сосальщики, Трематоды, Ленточные черви), тип Круглые черви (классы Нематоды, Волосатики, Скребни, Коловратки), тип Кольчатые черви (классы Многощетинковые черви, Малощетинковые черви, Пиявки), тип Членистоногие (классы Ракообразные, Мечехвосты, Паукообразные, Многоножки, Насекомые), тип Моллюски (классы Брюхоногие, Двустворчатые, Головоногие), тип Иглокожие (классы Морские лилии, Морские звезды, Морские ежи, Голотурии), тип Хордовые (подтип Оболочники, подтип Бесчерепные и подтип Позвоночные, включающий классы – Круглоротые, Хрящевые рыбы, Костные рыбы, Земноводные, Пресмыкающиеся, Птицы, Млекопитающие).

http://poznayka.org/s85023t1.html

Типы питания живых организмов

Все живые организмы, обитающие на Земле, представляют собой открытые системы, зависящие от поступления веще­ства и энергии извне. Процесс потребления вещества и энер­гии называетсяпитанием. Химические вещества необходимы для построения тела, энергия – для осуществления процессов жизнедеятельности.

Существует два типа питания живых организмов: автотрофное и гетеротрофное.

Автотрофы (автотрофные организмы) – организмы, использующие в качестве источника углерода углекислый газ (ра­стения и некоторые бактерии). Иначе говоря, это организмы, спо­собные создавать органические вещества из неорганических – углекислого газа, воды, минеральных солей. В зависимости от источника энергии автотрофы делят на фотоавтотрофов и хемоавтотрофов.Фототрофыорганизмы, использующие для биосинтеза световую энергию (расте­ния, цианобактерии).Хемотрофы организмы, использую­щие для биосинтеза энергию химических реакций окисления неорганических соединений (хемотрофные бактерии: водород­ные, нитрифицирующие, железобактерии, серобактерии и др.).

Гетеротрофы (гетеротрофные организмы) – организмы, использующие в качестве источника углерода органические соединения (животные, грибы и большинство бактерий). Иначе говоря, это организмы, не способные создавать органические вещества из неорганических, а нуждающиеся в готовых орга­нических веществах. По способу получения пищи гетеротрофы делят на фаготрофов (голозоев) и осмотрофов.Фаготрофы (голозои)загла­тывают твердые куски пищи (животные),осмотрофы погло­щают органические вещества из растворов непосредственно через клеточные стенки (грибы, большинство бактерий). По состоянию источника пищи гетеротрофы делятся на биотрофов и сапротрофов.

Биотрофы питаются живыми орга­низмами. К ним относятся зоофаги (питаются животными) и фитофаги (питаются растениями), в том числе паразиты.

Сапротрофы используют в качестве пищи органические вещества мертвых тел или выделения (экскременты) животных. К ним принадлежат сапротрофные бактерии, сапротрофные грибы, сапротрофные растения (сапрофиты), сапротрофные живот­ные (сапрофаги). Среди них встречаются детритофаги (пита­ются детритом), некрофаги (питаются трупами животных), копрофаги (питаются экскрементами) и др.

Катаболизм (энергетический обмен, диссимиляция) сово­купность реакций, приводящих к образованию простых ве­ществ из более сложных (гидролиз полимеров до мономеров и расщепление последних до низкомолекулярных соединений углекислого газа, воды, аммиака и др. веществ). Катаболические реакции идут обычно с высвобождением энергии.

Анаболизм (пластический обмен, ассимиляция) понятие, противоположное катаболизму: совокупность реакций синте­за сложных веществ из более простых (образование углеводов из углекислого газа и воды в процессе фотосинтеза, реакции матричного синтеза). Для протекания анаболических реакций требуются затраты энергии. Процессы пластического и энергетического обмена неразрывно связаны между собой. Все синтетические (анаболичес­кие) процессы нуждаются в энергии, поставляемой в ходе реакций диссимиляции. Сами же реакции расщепления (ка­таболизма) протекают лишь при участии ферментов, синтези­руемых в процессе ассимиляции.

Энергетический обмен.

По отношению к свободному кислороду организмы делятся на три группы: аэробы, анаэробы и факультативные формы.

Аэробы (облигатные аэробы) – организмы, способные жить только в кислородной среде (животные, растения, некоторые бактерии и грибы).

Анаэробы (облигатные анаэробы) организмы, неспособ­ные жить в кислородной среде (некоторые бактерии).

Факультативные формы (факультативные анаэробы) орга­низмы, способные жить как в присутствии кислорода, так и без него (некоторые бактерии и грибы). У облигатных аэробов и факультативных анаэробов в при­сутствии кислорода катаболизм протекает в три этапа: подго­товительный, бескислородный и кислородный. В результате органические вещества распадаются до неорганических соеди­нений. У облигатных анаэробов и факультативных анаэробов при недостатке кислорода катаболизм протекает в два первых этапа: подготовительный и бескислородный. В результате образуются промежуточные органические соединения еще бо­гатые энергией.

Этапы энергетического обмена (катаболизма):

Первый этап – подготовительный – заключается в фер­ментативном расщеплении сложных органических соединений на более простые. Белки расщепляются до аминокислот, жиры до глицерина и жирных кислот, полисахариды до моносахаридов, нуклеиновые кислоты до нуклеотидов. У многоклеточ­ных организмов это происходит в желудочно-кишечном трак­те, у одноклеточных – в лизосомах под действием гидролити­ческих ферментов. Высвобождающаяся при этом энергия рас­сеивается в виде теплоты. Образовавшиеся органические со­единения либо подвергаются дальнейшему окислению, либо используются клеткой для синтеза собственных органических соединений.

Второй этап – неполное окисление (бескислородный) –заключается в дальнейшем расщеплении органических веществ, осуществляется в цитоплазме клетки без участия кислорода. Бескислородное, неполное окисление глюкозы называется гликолизом.В результате гликолиза из одной молекулы глюко­зы образуются две молекулы пировиноградной кислоты (ПВК), при этом синтезируются две молекулы АТФ. Далее при отсутствии в среде кислорода ПВК перерабаты­вается либо в этиловый спирт – спиртовое брожение (в клет­ках дрожжей и растений при недостатке кислорода), либо в молочную кислоту – молочнокислое брожение (в клетках жи­вотных при недостатке кислорода). При наличии в среде кислорода продукты гликолиза претер­певают дальнейшее расщепление до конечных продуктов, то есть включаются в третий этап.

Третий этап – полное окисление (дыхание) – заключается в окислении ПВК до углекислого газа и воды, осуществляется в митохондриях, при обязательном участии кислорода.

Суммарное уравнение расщепления глюкозы в процессе клеточного дыхания:

С6Н12О6 + 6О2 + 38Н3РО4 + 38АДФ → 6СО2 + 44Н2О + 38АТФ

Таким образом, в ходе гликолиза образуются 2 молекулы АТФ, в ходе клеточного дыхания – еще 36 АТФ, в целом при полном окислении глюкозы – 38 АТФ.

Пластический обмен.

Гетеротрофные организмы строят соб­ственные органические вещества из органических компонен­тов пищи. Гетеротрофная ассимиляция сводится, по существу, к перестройке молекул: органические вещества пищи (белки, жиры, углеводы)простые органические молекулы (аминокислоты, жирные кислоты, моносахариды)макромолекулы тела (белки, жиры, углеводы).Автотрофные организмы способны полностью самостоятель­но синтезировать органические вещества из неорганических молекул, потребляемых из внешней среды. В процессе фото- и хемосинтеза, происходит образование простых органичес­ких соединений, из которых в дальнейшем синтезируются мак­ромолекулы: неорганические вещества (СО2, Н2О) простые органические молекулы (аминокислоты, жирные кислоты, моносахариды) макромолекулы тела (белки, жиры, углеводы).Рассмотрим наиболее важные, с точки зрения экологии, метаболические процессы пластического обмена – фотосин­тез и хемосинтез.

Фотосинтез (фотоавтотрофия) – синтез органических со­единений из неорганических за счет энергии света.

Суммар­ное уравнение фотосинтеза:

6СО2 + 6Н2О → С6Н12О6 + 6О2

Фотосинтез протекает при участии фотосинтезирующих пиг­ментов, обладающих уникальным свойством преобразования энергии солнечного света в энергию химической связи в виде АТФ. Процесс фотосинтеза состоит из двух фаз: световой и темновой. В процессе фотосинтеза кроме моносахаридов (глюкоза и др.) синтезируются мономеры других органических соедине­ний – аминокислоты, глицерин и жирные кислоты. Таким образом, благодаря фотосинтезу растения обеспечивают себя и все живое на Земле необходимыми органическими веще­ствами и кислородом.

Хемосинтез (хемоавтотрофия) – процесс синтеза органи­ческих соединений из неорганических (СО2 и др.) за счет хи­мической энергии окисления неорганических веществ (серы, водорода, сероводорода, железа, аммиака, нитрита и др.). К хемосинтезу способны только хемосинтезирующие бак­терии: нитрифицирующие, водородные, железобактерии, се­робактерии и др. Они окисляют соединения азота, железа, серы и других элементов. Все хемосинтетики являются облигатными аэробами, так как используют кислород воздуха. Нитрифицирующие бактерии окисляют соединения азота, железобактерии превращают закисное железо в окисное, серобактерии окисля­ют соединения серы.Высвобождающаяся в ходе реакций окисления энергия за­пасается бактериями в виде молекул АТФ и используется для синтеза органических соединений. Хемосинтезирующие бак­терии играют очень важную роль в биосфере. Они участвуют в очистке сточных вод, способствуют накоплению в почве ми­неральных веществ, повышают плодородие почвы.

http://poznayka.org/s85024t1.html


Читайте также:


Рекомендуемые страницы:

Поиск по сайту

Разнообразие живых организмов. Классификация пяти королевств Классификация пяти королевств, самая современная классификация была дана Уиттакером… Уиттакером.

Презентация на тему: «Разнообразие живых организмов. Классификация пяти царств Классификация пяти царств, самая современная классификация была дана Уиттакером …… Уиттакер» - стенограмма презентации:

1 Разнообразие живых организмов

2 Классификация пяти королевств Классификация пяти королевств, наиболее современная классификация была дана Уиттакером… Уиттакер разделил живые организмы на следующие пять королевств: Monera Protista Fungi Plantae Animalia

3 Королевство Монера Следующие особенности принадлежат королевству Монера: Старейшие формы жизни  Прокариоты  Одноклеточные  некоторые из них автотрофны (например, цианобатерии) или гетеротрофны (например, E.coli)  Например, микоплазма, цианобактерии, кишечная палочка и т. д.

4 Королевство протистов протиста имеет следующие особенности:  эукариоты  в основном одноклеточные  некоторые автотрофные и некоторые гетеротрофные  предпочитают влажную среду обитания  например, простейшие, эвглены, амебы и т. Д.

5 Царственные грибы Особенности грибов: o Эукариоты o Многоклеточные o Гетеротрофные o Неподвижные o Клеточная стенка хитина o Размножение спорами

6 Kingdom Plantae  Eukaryotes  Многоклеточный  Автотрофный  Неподвижный  Наличие клеточной стенки


7 Kingdom Animalia Eukaryotes Многоклеточные Гетеротрофные В основном мобильные Без клеточной стенки

таксономия | Определение, примеры, уровни и классификация

Таксономия , в широком смысле наука о классификации, но более строго классификация живых и вымерших организмов - i.е., биологическая классификация. Термин происходит от греческих taxis («договоренность») и nomos («закон»). Таксономия, таким образом, представляет собой методологию и принципы систематической ботаники и зоологии и устанавливает расположение видов растений и животных в иерархиях высших и подчиненных групп. Среди биологов международно признана система биномиальной номенклатуры Линнея, созданная шведским естествоиспытателем Каролусом Линнеем в 1750-х годах.

Таксономия животных

Животные и другие организмы классифицируются внутри ряда вложенных групп, которые варьируются от общих до частных.

Encyclopædia Britannica, Inc.

Британская викторина

Биология Бонанза

Что означает слово «миграция»? Сколько комплектов ножек у креветки? От ядовитой рыбы до биоразнообразия - узнайте больше об изучении живых существ в этой викторине.

Обычно классификации живых организмов возникают в соответствии с потребностями и часто являются поверхностными.Англосаксонские термины, такие как червь и рыба , использовались для обозначения любого ползучего существа - змеи, дождевого червя, кишечного паразита или дракона - а также любого плавающего или водного существа. Хотя термин рыба является общим для имен моллюсков , раков и морских звезд , анатомических различий между моллюском и морской звездой больше, чем между костлявыми рыбами и человеком. Народные имена сильно различаются.Американская малиновка ( Turdus migratorius ), например, не является английской малиновкой ( Erithacus rubecula ), а рябина ( Sorbus ) имеет лишь внешнее сходство с настоящим ясенем.

Однако биологи попытались изучить все живые организмы с одинаковой тщательностью и, таким образом, разработали формальную классификацию. Формальная классификация обеспечивает основу для относительно единообразной и международно понятной номенклатуры, тем самым упрощая перекрестные ссылки и поиск информации.

Использование терминов таксономия и систематика в отношении биологической классификации сильно различается. Американский эволюционист Эрнст Майр заявил, что «таксономия - это теория и практика классификации организмов», а «систематика - это наука о разнообразии организмов»; последняя в таком смысле, следовательно, имеет значительные взаимосвязи с эволюцией, экологией, генетикой, поведением и сравнительной физиологией, которых таксономия не обязана.

Получите эксклюзивный доступ к контенту из нашего первого издания 1768 с вашей подпиской.Подпишитесь сегодня

Историческая справка

Люди, живущие рядом с природой, обычно обладают отличным практическим знанием важных для них элементов местной фауны и флоры, а также часто узнают многие более крупные группы живых существ (например, рыб, птиц и млекопитающих ). Однако их знания соответствуют потребностям, и такие люди редко делают выводы.

Однако некоторые из самых ранних попыток формальной, но ограниченной классификации были предприняты древними китайцами и древними египтянами.В Китае каталог 365 видов лекарственных растений стал основой более поздних гидрологических исследований. Хотя каталог приписывается мифическому китайскому императору Шэннуну, который жил около 2700 г. до н.э., вероятно, он был написан в начале первого тысячелетия нашей эры. Точно так же древние египетские медицинские папирусы, датируемые 1700–1600 гг. До н. Э., Содержали описания различных лекарственных растений, а также указания о том, как их можно использовать для лечения болезней и травм.

От греков до эпохи Возрождения

Первым великим обобщителем в западной классификации был Аристотель, который фактически изобрел науку логики, частью которой на протяжении 2000 лет была классификация.Греки постоянно контактировали с морем и морской фауной, и Аристотель, кажется, интенсивно изучал их во время своего пребывания на острове Лесбос. В своих трудах он описал большое количество естественных групп, и, хотя он ранжировал их от простых к сложным, его порядок не был эволюционным. Однако он намного опередил свое время в разделении беспозвоночных животных на разные группы и знал, что киты, дельфины и морские свиньи имеют характеры млекопитающих и не являются рыбами. Без микроскопа он, конечно, не мог иметь дело с мельчайшими формами жизни.

Аристотелевский метод доминировал в классификации до 19 века. Его схема, по сути, заключалась в том, что классификация живого существа по его природе, то есть тому, чем оно является на самом деле, в отличие от поверхностных сходств, требует исследования многих образцов, отбрасывания переменных признаков (поскольку они должны быть случайными, а не случайными). существенное), и установление постоянных символов. Затем их можно использовать для разработки определения, которое устанавливает сущность живого существа - то, что делает его тем, чем оно является, и поэтому не может быть изменено; суть, конечно, неизменна.Модель этой процедуры можно увидеть в математике, особенно в геометрии, которая очаровывала греков. Математика казалась им типом и образцом совершенного знания, поскольку ее выводы из аксиом были точными, а ее определения совершенными, независимо от того, можно ли когда-нибудь нарисовать идеальную геометрическую фигуру. Но аристотелевская процедура, применяемая к живым существам, не является дедукцией из установленных и известных аксиом; скорее, это происходит путем индукции из наблюдаемых примеров и, таким образом, ведет не к неизменной сущности, а к лексическому определению.Несмотря на то, что на протяжении веков он предусматривал процедуру попыток определения живых существ путем тщательного анализа, в нем не учитывались вариации живых существ. Интересно, что те немногие люди, которые понимали книгу Чарльза Дарвина «Происхождение видов » в середине XIX века, были эмпириками, которые не верили в сущность каждой формы.

Аристотель и его ботаник Теофраст не имели заметных преемников в течение 1400 лет. Примерно в XII веке нашей эры необходимые для медицины ботанические труды стали содержать точные иллюстрации растений, и некоторые начали собирать похожие растения вместе.Энциклопедисты также начали объединять классическую мудрость и некоторые современные наблюдения. Первый расцвет Возрождения в биологии привел к появлению в 1543 году трактата Андреаса Везалия по анатомии человека, а в 1545 году - к созданию первого университетского ботанического сада в Падуе, Италия. После этого расцвела работа в области ботаники и зоологии. Джон Рэй обобщил в конце 17 века имеющиеся систематические знания с помощью полезных классификаций. Он отличил однодольные растения от двудольных в 1703 году, признал истинное родство китов и дал работоспособное определение концепции вида, которая уже стала основной единицей биологической классификации.Он умерил аристотелевскую логику классификации эмпирическим наблюдением.

ДНК и ее значение в таксономии

Таксономия включает описание, наименования и классификацию живых существ. Почему таксономия так важна? Что ж, это помогает нам классифицировать организмы, чтобы нам было легче передавать биологическую информацию. Таксономия использует иерархическую классификацию как способ помочь ученым понять и организовать разнообразие жизни на нашей планете. Иерархическая классификация в основном означает, что мы классифицируем группы внутри более крупных групп.

Базовая иерархия классификации морских слизней, которых я изучаю в Project Lab, описана ниже. Этот список является чрезмерным упрощением иерархической классификации, поскольку между показанными категориями есть категории. Иерархические названия организмов отражают общие физические атрибуты организмов, помещенных в эти группы. Например, все животные в составе Mollusca обладают мягким телом.

Возможно, вы слышали о научных названиях раньше и, возможно, заметили, что они состоят из двух частей.Научные названия организмов включают род, за которым следует название вида. Примером вида из семейства морских слизней, которое я исследую, является Doto ussi . Таксономия важна, поскольку другие научные дисциплины, такие как охрана природы и открытие лекарств, зависят от классификации и наименования организмов.

До того, как появилась возможность секвенировать ДНК, организмы описывались и классифицировались исключительно по их отличной морфологии (физическим характеристикам) и экологическим ролям. Способность секвенировать ДНК выявила гораздо больше о том, к какому таксономическому положению принадлежит организм, и помогает точно определить новые виды.В настоящее время ДНК используется наряду с морфологией и экологией, чтобы подтвердить отличительные особенности организма в биологическом мире.

Одним из компонентов моего дипломного проекта является изучение ДНК морских слизней Doto двух разных морфологий из Индо-Тихоокеанского региона. К этим морфологиям относятся образцы с коротким и удлиненным телом из Индонезии, Папуа-Новой Гвинеи и Филиппин. До проведения углубленного исследования эти удлиненные особи были помещены в семейство морских слизней Dotidae, несмотря на их уникальный внешний вид.

последовательности ДНК этих особей будут сравниваться с последовательностями ДНК с коротким телом, чтобы определить, действительно ли эти удлиненные образцы должны оставаться в пределах Dotidae. Мы действительно не знаем, к какой систематической принадлежности эти экземпляры относятся, поскольку они новы для науки. Это очень интересно, поскольку, возможно, потребуется создать новый род или семейство для размещения этих особей. Именно такие открытия делают науку такой полезной и увлекательной! ДНК действительно изменила то, как мы занимаемся наукой, и сделала классификацию организмов более конкретной.

Карисса Шипман
Магистр
Кафедра зоологии и геологии беспозвоночных

Характеристики и классификация живых организмов

ИДЕНТИФИКАЦИЯ ОРГАНИЗМОВ

отражать Взгляните на картинки справа.Подумайте, что общего у этих двух организмов. Им обоим нужна еда и вода, чтобы выжить. Они оба растут и размножаются. У них обоих одинаковый корпус

Подробнее

3.1 Типы живых существ

ГЛАВА 3 КЛАССИФИКАЦИЯ ЖИВОГО 3.1 Типы живых существ Оглянитесь вокруг. Какие виды живых существ вы видите? Вы, наверное, видите растения и животных.Что бы вы увидели, если бы смогли уменьшить

Подробнее

Таксономия и классификация

Таксономия и классификация Таксономия = наука называния и описания видов Мудрость начинается с называния вещей их правильными именами - музеи китайских пословиц содержат около 2 миллиардов экземпляров по всему миру

Подробнее

Классификация и эволюция

Классификация и начало эволюции: сколькими различными способами я мог бы разделить эти объекты на 2 группы? Классификация Все живые существа также можно сгруппировать, как мы решаем, в какие группы их помещать?

Подробнее

Классификация: Пятна и полосы

Биологическая классификация: пятна и полосы Зебры имеют характерный рисунок, который делает их легко узнаваемыми для большинства людей, но они также обладают чертами, общими для других животных.Итак, как мы можем легко

Подробнее

Практические вопросы 1: Эволюция

Практические вопросы 1: Эволюция 1. Какая концепция лучше всего проиллюстрирована на блок-схеме ниже? A. естественный отбор B. генетическая манипуляция C. динамическое равновесие D. материальные циклы 2. Диаграмма ниже

Подробнее

1 Характеристики живых существ

ГЛАВА 2 1 Характеристики живых существ РАЗДЕЛ Живое !! Или это? ПРЕЖДЕ ЧЕМ ПРОЧИТАЙТЕ Прочитав этот раздел, вы сможете ответить на следующие вопросы: Из чего сделаны все живые существа?

Подробнее

Сравнение растительных и животных клеток

1.2 Сравнение растительных и животных клеток Вот краткое изложение того, что вы узнаете в этом разделе: Структуры клеток растений и животных называются органеллами. Клетки растений и животных выполняют аналогичные функции,

Подробнее

Семь характеристик жизни

Дженнифер Хепнер Морин Франдсен, осень 2003 г. Уровень класса: 3-й класс Семь характеристик жизни Краткое содержание: Цель этого урока - познакомить учащихся с характеристиками живых организмов.

Подробнее

Клетки, ткани и органы

Глава 8: Клетки, ткани и органы Клетки: строительные блоки жизни Живые существа состоят из клеток. Многие химические реакции, поддерживающие жизнь организмов (метаболические функции), происходят в клетках.

Подробнее

Знакомство с животными

Введение в единство животных и разнообразие жизни В: Какие характеристики и черты определяют животных? 25.1 Что такое животное? ЧТО Я ЗНАЮ ОБРАЗЕЦ ОТВЕТА: Животные отличаются от других живых существ

Подробнее

Свидетельства в пользу эволюции

Теория эволюции путем естественного отбора подтверждается множеством доказательств. Окаменелости Окаменелости образуются, когда организмы погружаются в отложения, вызывая незначительное разложение организма.

Подробнее

Материалы и ресурсы:

Ключевые слова: классовая классификация, семейство, род, беспозвоночные, царство, порядок, тип, тип 1.Вовлечение: Введение: учащиеся изучают различные техники вопросов с помощью классификационной игры. Материалы

Подробнее

Введение в растения

Введение в единство растений и разнообразие жизни В: Какие пять основных групп растений и как четыре из этих групп адаптировались к жизни на суше? 22.1 Что такое растения? ЧТО Я ЗНАЮ ОБРАЗЕЦ ОТВЕТА:

Подробнее

Экосистемы и пищевые сети

Экосистемы и пищевые сети Как АИС влияют на наши озера? Справочная информация Все живое и неживое на планете взаимодействует.Экосистема определяется как набор элементов, живых и неживых,

Подробнее

Цветы; Семена в плодах

Имя Класс Дата Глава 22 Обзор раздела «Разнообразие растений» 22-1 Обзор ключевых понятий Краткий ответ В предоставленных строках ответьте на следующие вопросы. 1. Опишите основные характеристики растений.

Подробнее

Как понять человеческое тело

Введение в биологию и химию Краткое содержание I.Введение в биологию A. Определение биологии - Биология - это изучение жизни. Б. Характеристики жизни 1. Характерны форма и размер. например A

Подробнее

Глава 3L.4: Части тела и функции

Раздел 3L.4: Органы в организме человека Поддержание здоровья Навыки науки о скелете: Классификация Наблюдение Создание моделей Сбор данных По окончании этого раздела вы должны: Сравнить строение человека

Подробнее

Строения животных

Структуры животных Название: Все животные созданы с различными частями, которые мы называем структурами, из которых состоит их тело.Каждая из этих структур важна, поскольку она используется для выполнения определенного

Подробнее

Наблюдение за скелетами позвоночных

Имя Класс Дата Глава 33 Сравнение хордовых Наблюдение за скелетами позвоночных Введение Одной из характерных черт всех позвоночных является наличие скелета. Эндоскелет обеспечивает поддержку,

Подробнее

XII.Биология, 10 класс

XII. Биология, 10 класс Пилотный тест 10 класса по биологии Весной 2004 года тест MCAS по биологии для 10 класса был основан на учебных стандартах, содержащихся в разделе «Биология» в Массачусетском университете науки и технологий / инженерии

Подробнее

Биология MCAS. Пакет обзора

Пакет 1 обзора биологии MCAS Имя Класс Дата 1. Определите органический. ХИМИЯ ЖИЗНИ 2.Все живые существа состоят из 6 основных элементов: ГИРКА. Назовите шесть элементов жизни. S N P C O H 3. Элементы

Подробнее

Наука биологии

Глава 1 Биология Раздел 1 1 Что такое наука? (стр. 3 7) В этом разделе объясняется, какова цель науки, и описывается научный взгляд на мир. Что есть наука и чем она не является (стр.

) Подробнее

Живые существа и окружающая среда

Живые существа и окружающая среда (стр. 6 11) Среда обитания (стр. 7) Ключевое понятие: организм получает пищу, воду, убежище и другие вещи, необходимые для жизни, роста и воспроизводства из окружающей среды.Организм

Подробнее

Визуализация клеточных процессов

Визуализация клеточных процессов Серия из пяти программ, разработанных BioMEDIA ASSOCIATES Руководство по содержанию для программы 3 «Фотосинтез и клеточное дыхание» Авторские права 2001, BioMEDIA ASSOCIATES www.ebiomedia.com

Подробнее

Клетки и клеточные органеллы

Клетки и клеточные органеллы Строительные блоки жизни H Биология Типы клеток клетки бактерий Прокариоты - органелл отсутствуют Эукариоты - органеллы клетки животных клетки растений Сравнение размеров клеток Животная клетка

Подробнее

Клетки, которые делают нас Автор ReadWorks

«Клетки, которые делают нас. Клетки, которые делают нас» ReadWorks Мама, мне больно, - сказал Майк.Что случилось? - спросила мама Майка. Сегодня я споткнулся и упал, играя в футбол на детской площадке. Поцарапал колено,

Подробнее

Станция №1: Таксономия

Станция №1: Таксономия. Изучите таблицу с классификацией четырех организмов. Ответьте на вопросы. Таксон Зеленая лягушка Горный лев Домашняя собака Царство человека Тип Класс Порядок Семейство Род

Подробнее

Экзамены GCSE BITESIZE

Экзамены GCSE BITESIZE Общий аттестат о среднем образовании AQA SCIENCE A BLY1B Unit Biology B1b (Эволюция и окружающая среда) AQA BIOLOGY Unit Biology B1b (Evolution and Environment) FOUNDATION

Подробнее

Руководство по науке I в классе

SkillsTutor Science I Classroom Guide Содержание Начало работы... 1 Уроки естествознания I ... 2 Контрольные вопросы ... 2 Тесты ... 2 Краткое содержание уроков естественных наук I ... 3 Науки о жизни ... 4 Физические науки ... 6 Науки о Земле ... 8

Подробнее

PPT - Taxonomy PowerPoint Presentation, скачать бесплатно

  • Taxonomy • Современная наука о таксономии зародилась в середине 18 века. • основан Каролом Линнеем. Таксономия: идентификация, присвоение имен и классификация организмов. Систематика: наука о взаимоотношениях организмов друг с другом.Филогения: эволюционная история организма и его отношения с другими видами.

  • Филогенетическое дерево

  • Кладистика • Филогенетическое дерево построено с использованием признаков, унаследованных от общего предка. • Организмы, связанные по происхождению, называются кладой. • Производные символы: Челюсти Легкие Амниотическая мембрана Волосы Без хвоста Двуногие

  • Филогенетическое дерево из кладистики Последовательность ветвления подразумевает порядок появления новых признаков. Наиболее вероятная гипотеза, основанная на существующих доказательствах

  • Традиционная систематика • Домен (Супер Королевство) • Царство • Тип • Класс • Порядок • Семья • Род • Виды

  • Короли играют в шахматы на толстых парнях Желудки

  • Биномиальная система • Линней предложил для классификации латинскую систему с двумя именами.• Род: группа очень похожих организмов, связанных общим происхождением от недавнего предка и обладающих схожими физическими чертами. • Виды: особый вид организмов в роду. Группа внутри рода, которая имеет один и тот же набор структурных признаков и может успешно скрещиваться друг с другом. • Род и виды выделены курсивом, род с большой буквы.

  • Canisiliaris Домен: Царство эукариот: Animalia Тип: Chordata Класс: Mammalia Отряд: Carnivora Семейство: Canidae Род: Canis Виды: ownis Общее название: Dog

  • Pandinus imperator

  • Организмы: Линней: 2 царства - Plantae и Animalia Whittaker: 5 царств - Monera, Protista, Fungi, Plantae и Animalia Woese: 6 царств - Бактерии, Archaea, Protista, Fungi, Plantae и Animalia Woese (1996): 3 домена - Бактерии , Archaea and Eukarya

  • Прокариоты и протисты Глава 16

  • Домены организма Прокариоты Эукариоты • Размер 1-5 мкм • В 10 раз больше биомассы • Более широкий диапазон сред • Большее разнообразие хромосом • Одно, круговое разнообразие Наиболее известны как бактерии • Возбудители болезней являются патогенными микроорганизмами • Могут жить без других • Размер 10–100 мкм • Ядро, связанное с мембраной и органеллы • ДНК, расположенная на нескольких хромосомах • Не может жить без прокариот

  • Прокариотическая форма • Кокки • Сферические и образуют цепочки или кластеры • E.грамм. стрептококки и стафилококки • Бациллы • Палочковидные и встречаются по отдельности, парами или цепочками • Например, почвенные организмы • Различные формы • Вибрионы похожи на запятые • Спириллы - короткие, жесткие спиральные формы • Спирохеты длиннее и гибче

  • Прокариот Внешняя структура • Клеточная стенка • Бактерии могут быть в граммах (+) или граммах (-) • (+) простые стенки с более толстым пептидогликаном (сахарным полимером) • (-) более сложные стенки с меньшим количеством пептидогликана • Липиды и углеводы тоже, что делает их более опасными, токсичными и устойчивыми к антибиотикам • Капсула • Липкие полисахариды или белки, прикрепляющиеся к субстратам • Пили • Волосоподобные отростки для адгезии

  • Прокариотическая структура

  • Прокариотическая структура • Подвижность • Жгутики • Обнаженная белковая структура без микротрубочек, которая движется в виде пропеллера • Воспроизведение и адаптация • Разделить на бинарное деление • Скорость варьируется от часов до минут • Ограничена питательными веществами, конкуренцией, хищниками и накоплением отходов • Внутренняя организация • Небольшие генетические кольца, которые способствуют развитию устойчивости, называемые плазмидами • Рибосомы меньшего размера • Широкий спектр методов получения питательных веществ

  • Прокариотическое питание • Биопленки • Колонии поверхностного покрытия прокариот • Могут быть одного или нескольких видов • E.грамм. зубной налет, инфекции мочевых путей или канализационная очистка

  • Archaea • Живут там, где другие организмы не могут выжить • Экстремальные галофилы • Соляная среда • Например, Большое Соленое озеро, Мертвое море или пруды-испарители сточных вод • Экстремальные термофилы • Очень горячая вода • Например, океанические выходы или кислотные условия • Метаногены • Анаэробные среды с метаном в качестве побочного продукта • Например болота и желудочно-кишечные тракты животных

  • Типы бактерий • 9 групп • Протеобактерии • Грамотрицательные • Грамположительные • Хламидии • Спирохеты • Цианобактерии

  • Протеобактерии • Альфа (α) • Живут в корневых клубеньках, чтобы исправить атмосферный азот • Чужеродные носители ДНК в геномах сельскохозяйственных культур • Гамма (γ) • Фотосинтез • Населяют кишечник животных • E.gSalmonella, Vibriocholerae и Escheria coli • Дельта (δ) • Слизь, выделяющая миксобактерии • Может образовывать плодовые тела для себя при недостатке пищи • Нападает на другие бактерии

  • Актиномицеты • Грамположительные бактерии • Формируют колонии из разветвленных цепочек клеток или являются одиночными • Обнаружены в почве • Стрептомицин • культивируется фармацевтическими компаниями • Bacillus anthracis • Образует эндоспоры, клетки внутри клетки, которые обезвоживаются и находятся в состоянии покоя до тех пор, пока существуют более благоприятные условия • Стафилококк и стрептококк • Микоплазмы • Отсутствие клеточных стенок все известные клетки

  • Другой тип бактерий • Хламидии • Живут внутри эукариот • Распространенная причина слепоты (развивающиеся страны) и наиболее распространенные ЗППП (США) • Спирохеты • Спирохеты • Спирохеты • Спирохеты • Спирохеты • Спирали через окружающую среду за счет вращения внутренних волокон • E.gTreponemapallidum (сифилис) и Borreliaburgdorferi (болезнь Лайма) • Цианобактерии • Кислородсодержащий фотосинтез (только бактерии) • Пища для пресноводных и морских экосистем

  • Бактериальные яды • Экзотоксины - это белки, секретируемые бактериями • Могут существовать в бактериях • Clostridium tetani вызывает мышечные спазмы (тризм) • Золотистый стафилококк, часто встречающийся на коже и в носовых ходах • Вырабатывает несколько типов, вызывающих различные проблемы • Передается в результате генетической передачи между видами • E.coli, доброкачественный резидент кишечника • Приобретает гены, вызывающие вредное воздействие • Эндотоксины являются компонентами грамм (-) внешних мембран • Высвобождаются, когда клетка умирает или переваривается защитной клеткой • Вызывают те же общие симптомы • Neisseriameningitidis (бактериальный менингит) и Salmonella (брюшной тиф)

  • Контроль заболеваний • Улучшение санитарии • Водоочистка и канализационные системы • Разработка антибиотиков • Повышение бактериальной устойчивости • Образование • Важность обращения за лечением • Профилактика • Биологическое оружие

  • Биологическое оружие • Сибирская язва (сибирская язва) ( Bacillus anthracis) • Производят эндоспоры для распространения в воздухе • Попадая в легкие, они размножаются и производят экзотоксины • Антибиотики убивают бактерии, но не могут уничтожить их в организме • Легочная чума (Y.pestis) • Переносится по воздуху при кашле легочной ткани • Ботулинический токсотоксин (C. botulinum) • Самый смертоносный яд на земле • Блокирует передачу нервных сигналов для сокращения мышц • Ограниченная доступность антитоксина

  • Биовосстановление • Использование организмов для удаления загрязняющих веществ • Прокариотические разлагатели - основная сила в очистке сточных вод • Твердый ил из фильтров добавляется к колониям анаэробов • Преобразуется в удобрения или на свалку • Жидкие отходы поверх биопленок удаляют органический материал • Выбрасываются в водоемы • Разливы нефти и очистка участка добычи

    Протисты • Структура • Связанное с мембраной ядро ​​с хромосомами • Другие органеллы, характерные для эукариот • Жгутики и реснички в расположении микротрубочек 9 + 2 • Одноклеточные (большинство) • Наиболее часто встречаются везде, где есть вода • Некоторые из них возникли в результате вторичного эндосимбиоза • Симбиоз является тесная связь между 2 или более видами • Эндосимбионт - это вид, который живет тонкий другой вид

  • Дипломонады • Гетеротрофный • Возможно наиболее древний род • Отсутствие ДНК или цепи переноса электронов • Анаэробный • E.g Giardia Кишечник • Паразит, который получает питание от живых хозяев, которые травмированы им • Водяной паразит, часто попадающий в организм с фекальной загрязненной водой

  • Парабазалиды • Гетеротрофный • Анаэробно с некоторой энергией • Например, Trichomonas vaginalis • Путешествует по половым путям могут быть затронуты самки, но симптомы у мужчин встречаются реже • В настоящее время только лечение метронидазолом • Резистентность растет

  • Euglenozoans • Кристаллический стержень внутри жгутиков • Могут быть гетеротрофы, фотоавтотрофы и патогенные паразиты • E.g Трипаносома • Вызывает сонную болезнь • Передается африканской мухой цеце • Например, эвглена • Обычна в воде пруда

  • Альвеоляты • Мембранные мешочки под плазматической мембраной • Стабилизируют поверхность клеток или регулируют содержание ионов • Динофлагеллаты • Морские и свежий фитопланктон • Цветет красный прилив, токсины убивают рыбу и могут влиять на человека • Инфузории • 2 типа ядер, 1 для повседневной деятельности и 1 для размножения • Например, Paramecium или Stentor • Apicomplexans • Паразиты животных • E.g Плазмодий, вызывающий малярию

  • Amoebozoans • Перемещаются и питаются лопастными псевдоподиями, временными расширениями клетки • Паразитические амебы • Вызывают дизентерию • Слизневые плесени • Организмы, обнаруженные во влажном, разлагающемся веществе • Распространяются в благоприятных условиях в форме структуры, продуцирующие споры, под менее благоприятными • Плазмодий, единичная многоядерная масса цитоплазмы • Клеточные слизистые плесени, одиночные, пока не станет дефицит пищи

  • Фораминиферы и радиолярии • Передвигаются и питаются нитками, как псевдоподии • Форамы • Морские и пресноводные организмы • Имеют пористую оболочку из CaCO3, называемую тестами • Псудоподии проходят через • Радиолярии • Морские • Внутренняя оболочка из диоксида кремния и внешний тест

  • Stramenopiles • Множественные «волосатые» жгутики и один «гладкий» жгутик • Водные формы • Разлагаются мертвые растения и животные • Могут быть паразитическими (картофельный голод в Ирландии) • Диатомовые водоросли • Стекловидная клеточная стенка кремнезема • Свежие и морские организмы • Бурые водоросли • Автотрофные • Обычно называемые водорослями

  • Таксономия

    База данных таксономии, которая поддерживается группой UniProt, основана на базе данных таксономии NCBI, которая дополнена данными, специфичными для базы знаний UniProt Knowledgebase (UniProtKB).Хотя таксономия NCBI обновляется ежедневно для синхронизации с GenBank / EMBL-Bank / DDBJ, таксономия UniProt обновляется только в выпусках UniProt для синхронизации с UniProtKB. Поэтому может случиться так, что в течение периода времени выпуска UniProt вы можете найти новые таксоны в NCBI, которых еще нет в UniProt (и наоборот для удаленных таксонов).

    Виды с вручную аннотированными и проверенными последовательностями белков в разделе Swiss-Prot UniProtKB названы в соответствии с номенклатурой UniProt.В частности, мы приняли систематическое соглашение для обозначения штаммов и изолятов вирусов и бактерий.

    Ссылки на внешние сайты выбираются командой таксономии UniProt и показывают изображения и различные интересные научные данные (таксономия, биология, физиология и т. Д.). Из-за огромного объема данных, представленных во всемирной паутине, к сожалению, невозможно связаться с каждым сайтом индивидуально. Если вы хотите, чтобы на ваш сайт была ссылка с uniprot.org или вы предпочитаете, чтобы мы удалили ссылку на ваш сайт, не стесняйтесь обращаться к нам: help @ nulluniprot.nullorg.

    Поиск

    Вы можете запросить таксономию UniProt по именам таксонов или идентификаторам таксономии NCBI. При поиске по именам регистр не учитывается, и вы можете использовать звездочки в качестве подстановочных знаков в любом месте запроса. При поиске названий таксонов результаты, соответствующие наименованию организмов UniProt, получают более высокий рейтинг, чем результаты, соответствующие названиям других организмов.

    Номинал организма

    Наименование организма, используемое в UniProtKB, состоит из латинского научного названия, обычно состоящего из названий родов и видов (биномиальная система, разработанная Линнеем), за которыми необязательно следует английское общее название и синоним.

    Пример: Cardamine pratensis (цветок кукушки) (альпийский горький кресс-салат)

    Синонимом может быть обычное имя на английском языке или на латыни в случае некоторых исторически унаследованных имен.

    Пример: Radianthus magnifica (Великолепный морской анемон) (Heteractis magnifica)

    В случае вирусов наименование не соответствует биномиальной системе. Общепринятое английское название используется как научное название, иногда за ним следует акроним. По возможности, вирусы именуются в соответствии с номенклатурой Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).

    Мнемоника организма

    В названии записей UniProtKB используется мнемонический идентификационный код организма, состоящий не более чем из 5 буквенно-цифровых символов, например SP0A_ BACSU . Этот код обычно состоит из первых трех букв названия рода и первых двух букв названия вида.

    Примеры:
    PSEPU для Pse udomonas pu tida
    NAJNI для Naj и ni vea.

    Однако для ряда видов, часто встречающихся в UniProtKB, мы используем понятные коды. Всего таких кодов 16:

    • BOVIN для КРС
    • Цыпленок для курицы
    • ECOLI для Escherichia coli
    • HORSE для лошади
    • ЧЕЛОВЕКА для Homo sapiens
    • КУКУРУЗА для кукурузы ( Zea mays )
    • МЫШЬ для мыши
    • ГОРОХ садовый ( Pisum sativum )
    • СВИНЬЯ для свиньи
    • RABIT для кролика
    • RAT для Rat
    • ОВЦА для овец
    • SOYBN для сои ( Glycine max )
    • TOBAC для табака обыкновенного ( Nicotina tabacum )
    • ПШЕНИЦА на пшеницу ( Triticum aestivum )
    • ДРОЖЖИ для пекарских дрожжей ( Saccharomyces cerevisiae )

    Поскольку приведенные выше правила не могут применяться к вирусам, мы присваиваем им произвольные, но обычно легко запоминающиеся идентификационные коды.

    Полный список мнемоник организмов доступен в нашем контролируемом словаре видов.

    Коды, начинающиеся с цифры 9, используются для более высоких узлов, которые группируют организмы на заданном таксономическом уровне.

    Примеры:
    9AMPH для Amphibia
    9COLE для Coleoptera.

    Другие названия организмов

    Номенклатура организмов всегда была областью, в которой творчество биологов неизменно достигало неожиданных высот. На практике это означает, что один организм часто описывается множеством разных имен.В дополнение к наименованию организма, которое отображается в записях UniProtKB, записи таксономии UniProt также показывают все другие названия, которые заархивированы в базе данных таксономии NCBI. Это включает имена, классифицируемые как неправильно написанные, и неправильные названия, которые были собраны из различных внешних источников и могут считаться устаревшими данными.

    Узел происхождения и таксономии, ранг

    Таксономия организована в виде древовидной структуры, которая представляет таксономическое происхождение. Положение каждого узла на дереве определяется его рангом в иерархии таксономии, поэтому последние ранги (обычно вида или подвида ) представляют листья на ветвях дерева и более высоких рангах (например, вида или подвида ).грамм. тип , порядок и семейство ) расположены выше на дереве. Упорядоченный список узлов формирует родословную.

    База данных таксономии UniProt хранит древовидную структуру таксономии, что позволяет переходить от одного узла к другому и получать доступ к происхождению каждого узла.

    Для удобства записи GenBank / EMBL-Bank / DDBJ и UniProtKB хранят сокращенную родословную, которая содержит только знакомые названия таксонов. Но когда вы просматриваете запись UniProtKB на этом веб-сайте, вы можете настроить его поле «Таксономическая линия происхождения» для отображения полной линии происхождения, включая так называемые «скрытые узлы», которые не отображаются в сокращенной линии происхождения.Кроме того, при поиске таксона в UniProtKB на этом веб-сайте поиск таксона выполняется по всей линейке записей.

    Штаммы организмов

    Список штаммов может быть предоставлен для организмов с хотя бы одной записью в UniProtKB / Swiss-Prot. Если возможно, синонимы для конкретных названий штаммов перечислены серым после основного названия (см. Пример ECOLX). В записях UniProtKB названия штаммов отображаются в строках «Штаммы» в разделе «Публикации» (см. Пример P42652).

    Примечание. Некоторые из штаммов, представленных в списке штаммов, могут иметь свой собственный таксон в базе данных таксономии NCBI.Политика описания исходного организма для последовательности менялась с годами от вида к штамму и обратно к видам, поэтому в базах данных нуклеотидов и белков вы найдете смесь видов и назначений штаммов.

    Вирусные хосты

    Список естественных хостов дается для всех вирусов с хотя бы одной записью в UniProtKB / Swiss-Prot. Данные о вирусных хостах отображаются в поле «Virus host» записей UniProtKB (см. Пример Q8JP02).

    Вирус - это инертная частица вне своего хозяина.Вирион (так называемый, потому что он не виден под микроскопом) сам по себе не имеет ни метаболизма, ни репликационной способности, ни автономной эволюции. Вирус нельзя рассматривать как живой организм вне своего хозяина. Вирусная таксономия произвольно основана на природе вирусных геномов, и вирусы одного семейства могут инфицировать широкий круг хозяев, от млекопитающих до насекомых. Природа хоста не всегда отображается в имени вируса, например хозяева вируса желтой головы - креветки.
    Существует множество взаимодействий вируса с хозяином:

    • отключение тракции
    • иммуноэвазия
    • задержка
    • онкогенез со стороны вируса и антивирусное состояние
    • презентация антигена
    • Иммунная система на стороне хозяина

    Эти взаимодействия появляются в аннотации вирусных записей UniProtKB под различными типами аннотаций, такими как функция, субъединица, субклеточное расположение и PTM.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.